您好!欢迎访问保定米奇生物科技有限公司网站!
全国服务咨询热线:

19801430409

当前位置:首页 > 技术文章 > 产品速推:SWIFT AMPLICON 16S+ITS PANEL

产品速推:SWIFT AMPLICON 16S+ITS PANEL

发布时间:2021-05-14      点击次数:183

SWIFT AMPLICON 16S+ITS PANEL - 基于单管反应微生物高通量综合分析方法

 产品特点:

• 解析复杂的宏基因组样品

  单管多重引物混合物,可以覆盖16S rRNA的所有可变区和真菌的ITS1、 ITS2基因区域。 

• 解决了测序复杂度问题

  独特的扩增子化学试剂产出多样性的簇,不需要PhiX或者定相引物,有效reads数量至少增      加了20%。

• 节约成本

  适应多种Illumina®测序机型和测序读长,增大了选择的灵活性,可订购 384种index试剂盒         pooling更多样品。

• 快速的实验流程、高质量的数据

  从DNA样品到Illumina®测序文库的生成少于2小时,大大缩短了时间, 提高了效率。 

 

Swift Amplicon 16S + ITS Panel是基于16S rRNA可变区(V1-V9)和 ITS基因设计的单管多重引物体系,有利于对复杂的微生物群落(例如细菌, 古菌,真菌)的NGS分析。 

应用领域及样品类型:

  ● 宏基因组学: 细菌、古细菌、真菌;
         ● 环境学: 空气、水、废水等;
         ● 农业: 植物微生物, 土壤真菌(ITS)等;
         ● 微生物组学: 人体微生态,如皮肤、胃肠道、粪便等; 植物微生态,如表皮、根、土壤等;
         ● 法医: 根据微生物群落鉴定死亡时间等;
         ● 鉴定和检测复杂样品中细菌和真菌的结构。

完全覆盖细菌,古菌和真菌的鉴定可变区:

 Figure1.不同于传统的基于可变区域V3-V4或基于需要定相反向引物的特定区域的单重引物 16SrRNA的分析方法,SwiftAmplicon16S+ITSpanel对16S的全部可变区域和真菌的  ITS1/ITS2基因进行文库构建,能够提高文库的复杂度、检测灵敏度和序列的质量。

与基于V3-V4的检测方法相比SwiftAmplicon16S+ITSPanel更好地反映微生物群落多样性

Figure 2. 分别用 Swift Amplicon 16S+ITS Panel和 基于V3-V4 16S rRNA检测方法检测20种微生物(ATCC MSA-1003)的DNA混合物,并在Illumina® MiSeq® V3 (2×300bp reads)上测序;表明Swift Amplicon 16S+ITS Panel检测的灵敏度和准确度均高于基于 V3-V4的检测方法;红色虚线方框标识的菌种是 V3-V4 检测方法未检测到的菌种。 

结果一致性检测:不同的DNA起始量、样品类型和读长

Figure 3. 测试不同的样品DNA起始量10 pg到50 ng范围,利用Swift Amplicon 16S+ITS panel分别对MSA-1003 (下)和猪排泄物(左上)进行检测,不同样品起始量的检测结果在精确度 和物种相对丰度表现一致。

Figure 4. 利用Swift Amplicon 16S+ITS panel检测猪的排泄物中微生物 的种类,测试了PE150和PE300两种测序读长,检测到的物种数量相近。 

试剂盒订购信息 (部分)

 

 

 

 

 

保定米奇生物科技有限公司
地址:保定市惠阳街369号保定中关村创新基地研发中心15层1508室
邮箱:gatherbiotech@163.com
传真:
关注我们
欢迎您关注我们的微信公众号了解更多信息:
欢迎您关注我们的微信公众号
了解更多信息