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产品速推:SWIFT 2S TURBO v2 DNA建库试剂盒

发布时间:2021-07-29      点击次数:376
  优化的接头和试剂预混液,更高的产量,更低PCR dup率。
 
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产品特点:
 
  • 更低的起始量,更高分子复杂度文库产出
 
  1ng起始量,3倍以上dup率的降低
 
  • 改进杂交捕获流程所需的文库产量
 
  优化的PCR反应试剂预混液,更少的循环数设置
 
  • 1536种接头混合数量选择
 
  搭配可适配Normalase流程UDI预制板,允许多至1536种样本混合的自动化流程
 
  • 适用多种类型基因组
 
  同时兼不同复杂度的多种基因组类型。
 
  • 单一流程、多种应用
 
  用于研究全基因组,全外显子组或大基因的通用建库方案。
 
  Swift 2S Turbo V2 DNA建库试剂盒为Swift 2S Turbo DNA建库试剂盒升级版,可提供多种应用的解决方案,极大的简化了双链DNA 在Illumina?平台测序的NGS样品制备流程。 该技术提供快速及可高度重复的片段化文库构建方案,兼容自动化建库流程。
 
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低起始量及PCR-free建库流程
 
  优化的试剂预混液,以产生可适配于杂交捕获流程所需的文库产量,避免由于增加PCR循环数而产生的dup率。升级的试剂预混液也可用于杂交捕获流程中带磁珠的PCR扩增。
 
  支持100 ng 以上DNA起始量,通过连接反应加入长接头的PCR-free实验流程。小于100ng,甚至低至100pg DNA起始量,都可通过扩增或连接反应加入样本标签。
 
  如下图所示,Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒有两种工作流程。可选择您自己的全长测序接头搭配Swift 2S Turbo Flexible v2 (产品货号:47024或47096) 建库试剂盒(右侧流程),进行PCR-free文库构建流程。Swift 2S Turbo v2 (产品货号:46024或46096) 可搭配Swift非全长Y型接头(左侧流程)。
 
支持应用:
 
更高的文库产量,适用于杂交捕获流程
 
  特别优化的的PCR混合液可支持0.1–1000 ng DNA起始量及广泛的插入片段大小。实验使用Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒构建文库,将来自三种细菌菌株和人类细胞系Coriell NA12878的模拟群体的基因组DNA转化为插入大小为350bp或200bp的NGS文库。实验证明,升级版本vs的试剂盒其文库产量比Swift 2S Turbo试剂盒(v1版本)提高2至6倍(图A)。与v1版本相比,Swift 2S Turbo v2建库试剂盒搭配IDT xGenTM Pan-Cancer Panel 有着更高的覆盖率和靶向富集度(图B)
 
图A
 
图B
 
  由于Turbo v2 DNA建库试剂盒使用优化了的接头和试剂预混液,得到更高文库产量和更低的PCR dup率。(A)Swift 2S Turbo v2建库试剂盒在没有增加PCR循环数条件下,其文库产量比2S Turbo v1产量平均高4倍。(B) 2S Turbo v2平均覆盖度和目标区域(碱基)中靶率比例仍然很高。实验使用Illumina Miseq进行2 x 101 bp读长测序,每个样本的测序数据都均一至606k reads进行比较。
 
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低起始量,稳定的基因组覆盖度
 
  比较Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒与另一主流品牌、适配于酶切打断、使用标准HiFi DNA多聚酶的建库试剂盒。使用上述两种试剂盒搭配IDT xGenTM Pan-Cancer Panel用于评估杂交捕获表现(见下表)。与另一试剂盒相比,Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒以更少的PCR循环数产生同等的文库产量。特别地,Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒在低起始量样本中,有着更均一的插入片段大小、更高的目标覆盖度及更低的PCR率。
 
  使用1ng来自模拟细菌群落(ATCC? MSA-1000型?)的基因组材料,比较Swift 2S Turbo v2 与另一品牌的酶切打断建库试剂盒。实验证明,Swift 2S Turbo v2建库试剂盒通过更少的PCR循环数得到更高的文库产量、更低的dup率(见下表),并且在不同GC比例组成区域也有着更均一的覆盖度(见下图)。
 
                                    图A                                                图B
 
  Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒与基于酶切的竞争品牌相比,得到更高的平均覆盖度。使用1ng来自模拟细菌群落(ATCC? MSA-1000型?)的基因组材料,比较Swift 2S Turbo v2 DNA建库试剂盒(图A)与竞争品牌K(图B)。两款试剂盒均在PCR扩增纯化步骤使用0.65x 磁珠比例,实验使用Illumina Miseq进行2 x 101 bp读长测序,每个样本的测序数据都均一至5M reads。
 
  模拟微生物菌落本包含以下10种种群:B. cereus (GC% = 35.5), B. adolescentis (GC% = 59.4), C. beijerinckii (GC% = 29.9), D. radiodurans (GC% = 66.7), E. faecalis (GC% = 37.8), E. coli (GC% = 50.8), L. gasseri (GC% = 35.3), R. sphaeroides (GC% = 68.9), S. epidermidis (GC% = 32.0), S. mutans (GC% = 36.8)。
 
产品信息:

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