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Swift Rapid RNA Library Kit加速您的NGS转录组学研究

发布时间:2021-08-11      点击次数:99
  Swift Rapid RNA Library Kit为Illumina®测序平台NGS转录组学研究提供了最快,成本低的工作流程。该试剂盒利用的Adaptase®技术,可直接从第一链cDNA构建链特异性RNA文库,省去了常规第二链cDNA合成的繁琐。该试剂盒与许多上游和下游模块兼容,并且易于自动化。
 
  技术亮点:
 
  节省时间并降低成本
 
  3.5小时内完成高质量的文库构建
 
  支持多种工作流程,兼容多种Index选择,并且上机前可用Normalase Kit进行文库均一化处理
 
技术参数:
 
只需转换第一链cDNA,节省时间
 
  Swift Rapid RNA Library Kit利用Swift的Adaptase®技术,高效且快速的工作流程允许第一链cDNA直接加测序接头,而无需接头稀释。与其他支持相同起始量的品牌试剂盒相比,Swift建库更加节约了时间和成本。选择自动化可进一步加快您的RNA-Seq工作流程。
 
稳定的mapping率和链特异性
 
  与其他的RNA文库制备试剂盒相比,Swift Rapid RNA Library Kit具有mapping率高,保持高稳定的链信息优势
 
  UHR(Universal Human Reference)总RNA(Agilent 740000),Swift Rapid RNA Library Kit文库构建前使用 NEB Next poly(A)mRNA磁性分离模块(NEB E7490)富集;完全参照Supplier K推荐标准操作进行文库构建。MiniSeq PE75测序,Fastq数据均一化至3.8 million reads进行比较,STAR (mapping rate) 和rnaseqc (strand specificity )用于分析数据。
 
  不同的起始量,高重复性基因表达检测结果
 
  Swift Rapid RNA Library Kit可以在支持的起始量范围内保持高度重复检测转录本和基因表达。高度可信、一致性的数据结果,简洁实验流程加速您的研究。
 
  500 ng,250 ng及100ng UHR (Universal Human Reference)总RNA(Agilent 740000), Swift Rapid RNA Kit进行文库构建前通过 NEB Next poly(A)mRNA磁性分离模块(NEB E7490)进行富集。MiniSeq PE75测序,Fastq数据均一化至4.2 million reads进行比较,STAR,picard及RSeQC用于分析数据, 显示所有UCSC 转录组 (n = 78,807) FPKM(Fragments per million mapped reads per kilobase)值。
 
  Swift Normalase保留了RNA-Seq准确的转录本检测结果
 
  Swift Rapid RNA Library Kit与Swift Normalase试剂盒搭配使用,更多节省了从RNA样品到测序的整个流程时间。Swift Normalase kit通过酶促无偏好性选择文库并将其标准化至一致的浓度,以实现最佳的NGS测序簇生成。
 
  使用50ng 人脑mRNA样品构建四个RNA-Seq文库,其中两个文库使用Swift Combinatorial Dual Indexing primers(CD, 双端接头),另外两个文库使用Swift Combinatorial Dual Indexing Normalase primers (CDI-N,Normalase双端接头),都进行9个循环PCR扩增。测序上机前CD文库使用qPCR定量结果进行浓度均一化,而CDI-N文库通过Normalase kit文库浓度均一化至4nM。MiniSeq PE150同时进行测序。测序数据均一化至4 million reads进行比较,STAR,picard及RSeQC用于数据分析。每个样品前1000个转录本检测,Panther GO(Gene Ontology)证明了Normalase kit(右图)对RNA-Seq数据功能分析并无影响。
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