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杂交捕获的优缺点和目的是怎样的?

发布时间:2021-12-04      点击次数:158
  杂交捕获的目的是什么?
  在文库构建完成后,若是做全基因组测序,可直接将构建好的文库按照一定的浓度、测序深度、数据量进行上机测序即可。但在实际的操作中,由于人的基因组中存在大量丰富的重复DNA序列,且考虑到测序成本的问题,所以通常会进行靶向测序,即选择我们需要的区域进行测序,比如全外显子测序,或者针对肿瘤患者设计的特定的Panel测序等。获得所需的目标区域或者靶序列就需要探针与靶序列进行杂交,然后再通过捕获杂交片段的方法进行目标区域的富集。

  杂交捕获的优缺点:
  优点是捕获区段大,可以达到几百MB,超过PCR方案和MIP方案,同时根据探针的原理其均一性很好(均一性是评价捕获技术很关键的参数,均-性好后续测序成本就会下降)。
  缺点是因为杂交前样本会被随机打断(一般认为500bp是比较合适的长度),探针捕获时可能和目的片段部分杂交,导致一些含有部分目标区段的片段被捕获。所以杂交捕获的特异性较差,容易捕获非目标区段。

  杂交捕获测序非常灵敏,适用于检测单核苷酸变异、易位、结构变异、插入和缺失以及拷贝数变异。本公司提供基于杂交捕获的全套靶向序列捕获NGS产品,包括文库制备和靶向序列捕获试剂盒、外显子组、目录及定制探针、软件解决方案、样品质量控制和自动化平台。无论研究需要目录NGS基因组合还是包含目标基因的定制设计,都能为您提供相应解决方案。还提供了其他基于扩增子的靶向序列捕获技术选项,用于寻找特定的目标区域。
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