DNA建库方法大致可分为这几种类型
更新时间:2022-02-21 点击次数:3733
DNA分子的功能是贮存决定物种性状的几乎所有蛋白质和RNA分子的全部遗传信息,对DNA信息的解读,对于我们研究生命的奥秘、疾病的机理等有着重要的意义。DNA类的文库主要分为:DNA小片段文库、DNA大片段文库、Exon文库、PCR-Free文库和单细胞文库等。DNA建库方法是分子生物学的实验原理,其本质就是在待测片段两端加上接头的过程。
DNA小片段文库是指片段大小在1kb以下的普通DNA文库(200bp、350bp、500bp等),DNA小片段文库可用来进行人重测序,动植物、微生物的de novo和重测序,16s rRNA测序,宏基因组测序等项目类型的文库构建。
DNA大片段文库,又称之为末端配对(mate-paired)文库,片段长度大于1kb,主要用于动植物,微生物的de novo测序。
PCR-Free文库,顾名思义,就是在文库构建过程中不需要进行PCR的文库。主要是针对一些特殊样本,比如GC含量高、PCR扩增困难的样本和PCR产物。不足之处在于所需的样本起始量较少。
Exon文库:人类外显子组总共约30 Mb,占人类基因组约1%,外显子具有高度的保守型,且大部分疾病的致病位点位于外显子区。外显子测序是指利用序列捕获技术将外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。Exon文库主要用于人全外显子测序和目标区域测序。
单细胞DNA文库:随着二代测序技术的发展,把一次实验测许多条DNA序列的这个难题解决之后,一次把一个人的全基因组给测出来,最极限的情况,就是样本量少到一个细胞,就可以测出整个基因组的序列信息。
目前DNA建库方法按照接头连接方式不同可分为五类:
1、PCR扩增子建库;
2、Swift法建库;
3、转座酶法建库;
4、TA克隆连接接头建库;
5、平末端连接接头建库。