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品牌 | 其他品牌 | 供货周期 | 一个月 |
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应用领域 | 生物产业,农业 |
植物通用(被子开花植物)rRNA去除试剂盒
RNA测序是一种高度准确且灵敏的转录组追踪工具。然而,一些丰度很高的RNA种类却影响了NGS文库制备,浪费了宝贵的测序资源。
在提取到的总RNA中,核糖体RNA(rRNA)占95%左右,mRNA占2-3%,还有2-3%是非编码RNA,如Long non-coding RNA、tRNA、microRNA等。所以,在RNA测序的过程当中,首先要解决的问题,是如何去除核糖体RNA(rRNA)。
riboPOOL是来自德国的核糖体RNA去除产品,能够高效去除与研究无关的RNA,让研究人员更高效地利用测序资源。
Pan-Plant riboPOOL植物通用型核糖体RNA去除试剂盒,通用高效去除开花植物(被子植物)核糖体RNA.
1、高效的rRNA去除试剂
2、广泛覆盖开花植物
3、适合叶片、种子和根等各种组织部位
4、可去除28S, 18S, 5.8S & 5S rRNAü
5、可去除线粒体 rRNA
6、可去除质体rRNA(包括叶绿体)
7、高丰度的核糖体 RNA (rRNA)限制了转录组测序中目的RNA的检测。植物通用型 riboPOOL 为您提供特异性去除开花植物rRNA的通用解决方案,适合叶片、种子和根等各种组织部位,可去除细胞质(28S、18S、5.8S和5S)、质体和线粒体rRNA。
植物通用型 riboPOOL覆盖物种广泛
植物通用型 riboPOOL由生物素标记的DNA探针组成,可以覆盖开花植物的主要门类。
植物通用型 riboPOOL 可去除的植物物种包括30多个目(见下图)
常见物种,如下:
水稻、麻疯树、大豆、土豆 、棉花、咖啡、胡萝卜、洋蓟、橄榄、拟南芥、玉米、翠菊、小麦、苹果、橙子、荞麦及其他。
如果您感兴趣的物种不属于这些门类,请咨询我们的定制型 riboPOOL产品。
植物通用型 riboPOOL的测试结果不同门类中rRNA去除效率都很高;
植物通用型核糖体RNA去除试剂的β测试(客户测试)结果如下:开花植物的去除效率大于91%,测试物种为被子植物的蝶形花科、刺莲花科、芸苔属和蔷薇科的六种植物。值得注意的是,原始藻类绿藻在测试中的rRNA去除效率为80%,表明植物通用型riboPOOL可以应用于被子植物以外的植物门类。
测试数据由马克斯·普朗克基因组中心的Dr. Bruno Huettel和Dr. Christian Wöhle提供。用QIAgen RNeasy提取总RNA(1 μg,RIN ~8),用Pan-Plant riboPOOL法去除rRNA,然后用RNA XPClean (Beckman Coulter)纯化。分别使用NEB试剂盒(modified)和Illumina HiSeq3000进行文库制备和测序。
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植物通用(被子开花植物)rRNA去除试剂盒产品形式:
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