一、myBaitsExpert–Plant–Angiosperms-353产品概述 myBaits® Angiosperms353是从600种被子植物中,筛选353个单拷贝核基因,作为捕获序列,利用k-medoid聚类法设计靶向捕获探针,生物素化的RNA探针长度120bp,对被子植物的353个单拷贝核基因进行定向捕获测序。平均每个物种覆盖283个基因,所有被子植物至少覆盖100个直系同源单拷贝核基因。每个物种至少靶向137kbp,最大捕获区域为250kbp,另外覆盖了212kbp的非编码区。
二、myBaitsExpert–Plant–Angiosperms-353产品特点
1.低投入-节约时间成本和经费成本;
2.覆盖广-捕获覆盖整个目标序列;
3.低起始量-1ng-3μg,推荐100-500ng;
4.兼容性-兼容NGS文库制备,允许多个碱基错配;
5.高精度-近缘和远缘的个体或者种群精准捕获,不引入biases;
6.高通量-多个文库同一反应进行,每个反应pooling2-16个样本;
7.通用性-适用于被子植物的系统进化分析,建立DNA条形码;
三、产品应用
1.系统发生学
2.进化关系的分析
3.内含子测序
4.发现可变区域
5.DNABarcoding
6.对目标序列的富集程度进行评价
四、解决方案
我们提供的不仅仅是Angiosperms353产品,而是基于靶向捕获测序技术的基因组学整体解决方案!
完整流程:DNA提取→纯度和浓度检测→DNA片段化→测序文库制备→文库质检→杂交捕获→捕获序列富集→PCR产物纯化→PCR产物质检→测序→生物信息学分析。