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ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation and high-throughput Sequencing,染色质免疫共沉淀测序)是将染色质免疫共沉淀和高通量测序相结合,通过组蛋白的特异性抗体,将带有特定修饰的组蛋白-DNA复合物沉淀下来,从而获取该组蛋白结合的DNA。通过DNA高通量测序和分析,获得该组蛋白在染色体上的分布情况,并鉴定与该组蛋白有相互作用的DNA片段信息。
技术流程:
我们可为您提供组蛋白ChIP-seq(蛋白-DNA互作研究)技术服务,欢迎咨询!
需提供材料 | 交付结果 |
细胞:细胞数量>2*106 新鲜/冻存组织:动物组织500mg,植物组织1g | 实验过程图 高通量测序数据 生物信息学分析结果 |
更多技术服务:
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)
在全基因组水平上鉴定转录因子的结合位点,预测转录因子潜在的靶基因。
DAP-seq 技术的出现,使转录因子结合位点的研究不再局限于生物物种,不再受抗体质量的限制,进一步拓展并加深了生命科学领域研究的广度和深度。
DAP-seq与RNA-seq联合分析
分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。
凝胶阻滞或电泳迁移率实验 (EMSA)
鉴定或验证 DNA 结合蛋白和 DNA 序列的相互作用。
酵母单杂交技术 (Yeast One-Hybrid)
确定已知 DNA 和蛋白质之间是否存在相互作用。
筛选结合于目标顺式作用元件或其他短 DNA 序列的新蛋白。
鉴定蛋白结合 DNA 的结构域,精准定位与DNA 结合的蛋白序列。
DNA pull down
鉴定与DNA序列结合的蛋白质,该技术可用于筛选调控某基因启动子区域的潜在转录因子。
Halo pull down
检测已知蛋白质之间的相互作用,鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。
重组蛋白表达
有大肠杆菌、酵母、昆虫细胞、哺乳动物细胞4种蛋白表达系统可供选择。
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