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CUT&Tag(DNA-蛋白互作研究)

简要描述:CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA与蛋白互作的新技术。与ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交联和免疫共沉淀,而是通过靶蛋白的抗体和Protein A的介导,使Protein A融合的Tn5转座酶靶向并切割DNA,同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成高通量测序文库。
CUT&Tag(DNA-蛋白互作研究)

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  • 厂商性质:生产厂家
  • 更新时间:2023-05-26
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详细介绍

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CUT&Tag(DNA-蛋白互作研究)


CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA与蛋白互作的新技术。与ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交联和免疫共沉淀的过程,而是通过靶蛋白的抗体和Protein A的介导,使Protein A融合的Tn5转座酶靶向并切割DNA,同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成高通量测序文库。


技术流程

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细胞与ConA beads结合——细胞渗透性处理——一抗与目的蛋白特异性结合——二抗结合一抗放大信号——加入pA-Tn5与抗体结合——通过Mg2+激活转座体,片段化目的蛋白结合的DNA,并加上接头序列——DNA提取与扩增-高通量测序


客户提供材料交付结果

冻存细胞:细胞数>10万

冻存组织:组织量>40 mg

一抗(请使用ChIP级别的一抗,提供未稀释的抗体原液,

送样前请将抗体的说明书发给我们,以便安排后续实验)

实验过程图

高通量测序原始数据

生物信息学分析结果









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使用CUT&Tag,鉴定H3K27me3在染色质水平上的peaks。与ChIP-seq相比,在相同Reads条件下,两者的Peaks一致,并且CUT&Tag的信噪比更高、背景更低。


参考文献

Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5.


技术对比

CUT&Tag,DAP-seq,ChIP-seq技术对比
技术名称CUT&TagDAP-seqChIP-seq
实验模式体内体外体内
是否需要特异性抗体
样本适用性对细胞活性要求高,不兼容冷冻样本,能够对极少量样品进行分析各种组织器官,新鲜组织、冻存组织皆可各种组织器官,新鲜组织、冻存组织皆可
信噪比背景噪音低,所需测序深度少噪音高,所需测序量相对较多噪音高,所需测序量相对较多














我们可为您提供CUT&Tag(DNA-蛋白互作研究)技术服务,欢迎咨询!


更多技术服务:

DNA亲和纯化测序(DAP-seq)

在全基因组水平上鉴定转录因子的结合位点,预测转录因子潜在的靶基因。

DAP-seq 技术的出现,使转录因子结合位点的研究不再局限于生物物种,不再受抗体质量的限制,进一步拓展并加深了生命科学领域研究的广度和深度。

DAP-seq与RNA-seq联合分析

分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。

酵母单杂交技术 (Yeast One-Hybrid)

确定已知 DNA 和蛋白质之间是否存在相互作用。

筛选结合于目标顺式作用元件或其他短 DNA 序列的新蛋白。

鉴定蛋白结合 DNA 的结构域,精准定位与DNA 结合的蛋白序列。

Halo pull down

检测已知蛋白质之间的相互作用,鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。

重组蛋白表达

有大肠杆菌、酵母、昆虫细胞、哺乳动物细胞4种蛋白表达系统可供选择。

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