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16S+ITS测序的原理和用途

发布时间:2021-09-01      点击次数:490
  16S+ITS测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,目前主要是应用高通量测序技术对特定环境中特定遗传物质进行测序。大多数天然微生物都不能通过传统的分离培养方法进行分离和克隆,这对于天然微生物定性和定量,探索微生物多样性是严重的挑战。扩增子测序可以克服传统分离培养的弱点,对样品中的微生物进行定性和定量,目前在微生物多样性检测中广泛应用。
  16S+ITS测序的原理和用途:
  16SrDNA测序:16SrDNA是编码16SrRNA的基因,存在于所有细菌基因组。其既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,目前被广泛用于病原菌的检测和鉴定。它的可变区经常用于不同微生物群落的属或种系统进化分类。
  ITS测序:在真核生物中,18SrDNA和28SrDNA转录间隔序列称为ITS区。由于其是非转录区,承受的选择压力较小,变异强;属于中度保守区域,利用它可研究种及种以下的分类阶元。
  16S+ITS测序技术优势:
  较低的成本:与宏基因组测序相比,对测序深度的要求更低,性价比较高;
  鉴定效率高:与克隆或培养等传统鉴定方法相比,微生物群16S/ITS测序是一种更快、更准确的方法。
  高灵敏度:可以鉴定出丰度极低的细菌。
  双区检测:针对一个或多个可变区域的灵活性,能够进行更长的序列读取,并能够对菌落进行更准确的分析。

16S+ITS测序

 

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