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DAP-seq

简要描述:转录调控-DAP-seq
100+物种,2000+转录因子的实战经验。
无需抗体,高通量鉴定转录因子的下游基因,蓝景科信已助力客户在许多期刊发表文章,例如:Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Journal of Integrative Plant Biology,New Phyto

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  • 厂商性质:生产厂家
  • 更新时间:2024-04-26
  • 访  问  量:805

详细介绍

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DAP-seq:转录因子结合位点研究新方法


在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而,好的抗体可遇不可求,这限制了ChIP-seq更广泛的应用。


DAP-seq技术的出现,使TFBS 的研究不再局限于物种,不再受抗体质量的限制,为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。


DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。


蓝景科信为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析,具有100多个物种,2000多个转录因子的实战经验。欢迎咨询。



DAP-seq


服务内容:

服务项目周期交付结果
蛋白表达载体构建1-2周

构建载体的测序结果

实验过程图

原始测序数据

分析结果

蛋白无细胞表达1-2周
DAP-seq文库构建1周
DNA亲和纯化1-2周
上机测序2周
标准数据分析2周

       



已做物种:

植物

拟南芥

茎瘤芥

甘蓝型油菜

白菜型油菜

不结球白菜

菜心

小麦

大麦

花生

辣椒

番茄

草莓

黄花棘豆

苦荞

红薯

木薯

马铃薯

普通烟草

人参

鸭茅

罂su

甘蔗

短芒大麦草

二色补血草

烟草

百脉根

芍药

丹参

狗尾草

菠菜

玉米

大豆

高粱

藜麦

陆地棉

甜瓜

黄瓜

葡萄

灰毡毛忍冬

粉葛

三叶青

猕猴桃

香蕉

蒺藜苜蓿

紫花苜蓿

伴矿景天

苔藓

地钱

毛果杨

717

84K

小黑杨

胡杨

山新杨

小叶杨

欧美杨

大青杨

毛白杨

刚毛柽柳

白桦

光皮桦

油松

毛竹

麻竹

银杏

油桐

荔枝

柑橘

甜橙

欧洲云杉

核桃

柿子

闽楠

木荷

脐橙

板栗

杜梨

苹果

樱桃

麻疯树

茶树

月季

海岛棉

白木香

橡胶树

三角褐指藻

芥蓝

蓝花耧斗菜

盐芥

无花果

菠萝

西瓜

甘薯

竹叶花椒

玫瑰

动物

飞蝗

新孢子虫

烟粉虱

草地贪夜蛾

真菌

拟轮枝镰孢菌

猪苓真菌

意大利青霉

草酸青霉

腐霉

金黄壳囊孢

灵芝

糙皮侧耳

草菇

灰盖鬼伞

虫草

亚洲镰刀菌

蝗绿僵菌


细菌

路德维希肠杆菌

嗜热厌氧杆菌

生氮假单胞菌

伯克赫尔德氏菌

布鲁氏菌

肺炎克雷伯菌


     








相关服务:

1、 凝胶阻滞实验(EMSA):DAP-seq后续验证服务。

2、 酵母单杂交:DAP-seq后续验证服务

3、 ChIP-seq:高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点

4、 DAP-seq与RNA-seq联合分析: 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。

5、 DNA-pull down:鉴定与DNA结合的蛋白。

6、 精美的论文图片设计与制作:专业设计师,设计精美论文插图,提升论文的严谨性和美观度。


DAP-seq:转录因子结合位点研究新方法

DAP-seq是基于DNA亲和纯化,通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术,具有不受抗体和物种限制,且高通量的优势,自该技术问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。能帮助您快速找到转录因子的结合位点,寻找转录因子调控的靶基因。



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