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在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而,好的抗体可遇不可求,这限制了ChIP-seq更广泛的应用。
DAP-seq技术的出现,使TFBS 的研究不再局限于物种,不再受抗体质量的限制,为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。
DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。
蓝景科信为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析,具有100多个物种,2000多个转录因子的实战经验。欢迎咨询。
服务内容:
服务项目 | 周期 | 交付结果 |
蛋白表达载体构建 | 1-2周 | 构建载体的测序结果 实验过程图 原始测序数据 分析结果 |
蛋白无细胞表达 | 1-2周 | |
DAP-seq文库构建 | 1周 | |
DNA亲和纯化 | 1-2周 | |
上机测序 | 2周 | |
标准数据分析 | 2周 |
已做物种:
植物 | ||||||||
拟南芥 | 茎瘤芥 | 甘蓝型油菜 | 白菜型油菜 | 不结球白菜 | 菜心 | 小麦 | 大麦 | 花生 |
辣椒 | 番茄 | 草莓 | 黄花棘豆 | 苦荞 | 红薯 | 木薯 | 马铃薯 | 普通烟草 |
人参 | 鸭茅 | 罂su | 甘蔗 | 短芒大麦草 | 二色补血草 | 烟草 | 百脉根 | 芍药 |
丹参 | 狗尾草 | 菠菜 | 玉米 | 大豆 | 高粱 | 藜麦 | 陆地棉 | 甜瓜 |
黄瓜 | 葡萄 | 灰毡毛忍冬 | 粉葛 | 三叶青 | 猕猴桃 | 香蕉 | 蒺藜苜蓿 | 紫花苜蓿 |
伴矿景天 | 苔藓 | 地钱 | 毛果杨 | 717杨 | 84K杨 | 小黑杨 | 胡杨 | 山新杨 |
小叶杨 | 欧美杨 | 大青杨 | 毛白杨 | 刚毛柽柳 | 白桦 | 光皮桦 | 油松 | 毛竹 |
麻竹 | 银杏 | 油桐 | 荔枝 | 柑橘 | 甜橙 | 欧洲云杉 | 核桃 | 柿子 |
闽楠 | 木荷 | 脐橙 | 板栗 | 枣 | 枳 | 杜梨 | 苹果 | 桃 |
樱桃 | 麻疯树 | 茶树 | 梅 | 月季 | 海岛棉 | 白木香 | 橡胶树 | 三角褐指藻 |
芥蓝 | 蓝花耧斗菜 | 盐芥 | 无花果 | 菠萝 | 西瓜 | 甘薯 | 竹叶花椒 | 玫瑰 |
动物 | ||||
驴 | 飞蝗 | 新孢子虫 | 烟粉虱 | 草地贪夜蛾 |
真菌 | ||||||
拟轮枝镰孢菌 | 猪苓真菌 | 意大利青霉 | 草酸青霉 | 腐霉 | 金黄壳囊孢 | 灵芝 |
糙皮侧耳 | 草菇 | 灰盖鬼伞 | 虫草 | 亚洲镰刀菌 | 蝗绿僵菌 |
细菌 | |||||
路德维希肠杆菌 | 嗜热厌氧杆菌 | 生氮假单胞菌 | 伯克赫尔德氏菌 | 布鲁氏菌 | 肺炎克雷伯菌 |
相关服务:
1、 凝胶阻滞实验(EMSA):DAP-seq后续验证服务。
2、 酵母单杂交:DAP-seq后续验证服务
3、 ChIP-seq:高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点
4、 DAP-seq与RNA-seq联合分析: 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。
5、 DNA-pull down:鉴定与DNA结合的蛋白。
6、 精美的论文图片设计与制作:专业设计师,设计精美论文插图,提升论文的严谨性和美观度。
DAP-seq:转录因子结合位点研究新方法
DAP-seq是基于DNA亲和纯化,通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术,具有不受抗体和物种限制,且高通量的优势,自该技术问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。能帮助您快速找到转录因子的结合位点,寻找转录因子调控的靶基因。
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